MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015922	GACT	2	8	24	31	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015922	TAA	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015922	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015922	T	8	8	154	161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015922	T	6	6	389	394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015922	T	6	6	396	401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015922	CTA	2	6	402	407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015922	TTAT	2	8	410	417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015922	A	6	6	4255	4260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015922	AT	3	6	4290	4295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015922	AT	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015922	A	7	7	4319	4325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015922	TTAA	2	8	4334	4341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015922	TAA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015922	CAA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015922	TTA	2	6	4416	4421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015922	TTA	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015922	A	7	7	4496	4502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015922	ATT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015922	TTTA	2	8	4563	4570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015922	A	6	6	4597	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015922	CAAAAC	2	12	4608	4619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015922	TATT	2	8	4625	4632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015922	CCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015922	T	6	6	4690	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015922	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015922	AAT	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015922	ATT	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015922	ATT	3	9	4730	4738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015922	TTA	2	6	4757	4762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015922	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015922	T	7	7	5650	5656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015922	TTC	2	6	5671	5676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015922	T	7	7	5679	5685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015922	AAATT	2	10	5725	5734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015922	AAAT	2	8	5744	5751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015922	AATTAA	2	12	5769	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015922	T	6	6	5980	5985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015922	TAA	2	6	6042	6047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015922	TAT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015922	TTC	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015922	AT	3	6	6138	6143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015922	TAAT	2	8	6153	6160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015922	ATT	2	6	6178	6183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015922	T	6	6	6256	6261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015922	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015922	TAC	2	6	6351	6356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015922	TAAAAA	2	12	6371	6382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015922	GCTTT	2	10	6436	6445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015922	GGAA	2	8	6473	6480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015922	A	6	6	6528	6533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015922	A	6	6	6685	6690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015922	AAAC	2	8	6760	6767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015922	ATT	2	6	6807	6812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015922	ATTT	2	8	7004	7011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015922	ATG	2	6	7019	7024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015922	A	6	6	7025	7030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015922	T	6	6	7041	7046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015922	T	6	6	7067	7072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015922	T	6	6	7079	7084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015922	T	6	6	7105	7110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015922	CTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015922	TTA	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015922	TA	3	6	7164	7169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015922	ATTT	2	8	7208	7215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015922	AT	3	6	7225	7230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015922	T	7	7	7230	7236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015922	A	7	7	7237	7243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015922	TAT	2	6	7246	7251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015922	CTT	2	6	7267	7272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015922	CAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015922	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015922	ATA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015922	T	6	6	7461	7466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015922	ATA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015922	GTTGAT	2	12	7552	7563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015922	T	6	6	7572	7577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015922	A	6	6	7610	7615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015922	GCAAAG	2	12	8523	8534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015922	ATTTA	2	10	8583	8592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015922	ATA	3	9	8596	8604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015922	T	6	6	8614	8619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015922	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015922	A	7	7	8683	8689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015922	TTA	2	6	8690	8695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015922	TAAA	2	8	8728	8735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015922	T	6	6	8751	8756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015922	TTA	2	6	8770	8775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015922	T	6	6	8828	8833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015922	TTC	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015922	T	7	7	8901	8907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015922	TAT	2	6	8915	8920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015922	AATT	2	8	8927	8934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015922	T	8	8	8946	8953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015922	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015922	TA	3	6	8981	8986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015922	CAA	2	6	9006	9011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015922	ATT	2	6	9031	9036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015922	TAA	2	6	9052	9057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015922	A	6	6	9070	9075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015922	ATT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015922	AAATA	2	10	9110	9119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015922	TTTA	2	8	9129	9136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015922	TAA	2	6	9146	9151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015922	TTAA	2	8	9170	9177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015922	ATA	2	6	9365	9370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015922	AGA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015922	A	6	6	9422	9427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015922	A	7	7	9450	9456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015922	A	6	6	9467	9472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015922	A	7	7	9496	9502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015922	AT	3	6	9508	9513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015922	TA	3	6	9518	9523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015922	AAC	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015922	ATT	2	6	9613	9618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015922	TAT	2	6	9621	9626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015922	T	6	6	9635	9640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015922	AAT	2	6	9680	9685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015922	T	7	7	9726	9732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015922	ATAA	3	12	9765	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015922	AC	3	6	9904	9909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015922	TAA	2	6	10555	10560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015922	TAT	3	9	11083	11091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015922	AGA	2	6	11102	11107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015922	AATA	2	8	11108	11115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015922	A	7	7	11118	11124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015922	T	6	6	11137	11142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015922	TAT	2	6	11148	11153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015922	ATA	2	6	11176	11181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015922	AGC	2	6	11204	11209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015922	T	6	6	11220	11225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015922	ATC	2	6	11237	11242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015922	TTA	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015922	AAT	2	6	11300	11305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015922	A	7	7	11323	11329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015922	GATT	2	8	11358	11365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015922	T	6	6	11418	11423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015922	AAT	3	9	11453	11461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015922	CAC	2	6	11566	11571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015922	TAT	2	6	11589	11594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015922	ATA	2	6	11623	11628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015922	ATTT	2	8	11634	11641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015922	ATAA	2	8	11642	11649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015922	ATT	2	6	11679	11684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015922	TAT	2	6	11741	11746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015922	TA	3	6	12366	12371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015922	CCT	2	6	14758	14763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015922	ATA	2	6	14794	14799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015922	A	6	6	14833	14838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015922	T	6	6	14845	14850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015922	GTT	2	6	14872	14877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015922	GAATT	2	10	14882	14891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015922	ATG	2	6	14988	14993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015922	TAT	2	6	15029	15034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015922	TAT	2	6	15059	15064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015922	TTC	2	6	15151	15156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_015922	TA	3	6	15234	15239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015922	A	6	6	15864	15869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015922	TAA	2	6	15945	15950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015922	AAT	2	6	16002	16007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015922	A	6	6	16061	16066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015922	A	7	7	16792	16798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_015922	AATT	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015922	AAT	2	6	20491	20496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015922	AGAT	2	8	20512	20519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015922	A	6	6	20534	20539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015922	TAA	2	6	20540	20545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015922	AT	5	10	20549	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015922	A	7	7	20579	20585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015922	A	7	7	20607	20613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015922	TGA	3	9	20625	20633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015922	TTA	2	6	20645	20650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015922	CAT	2	6	20695	20700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_015922	ACAA	2	8	20702	20709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
299	NC_015922	TAC	2	6	20747	20752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_015922	TGA	2	6	20767	20772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015922	TA	3	6	20777	20782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015922	AAGA	2	8	20803	20810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015922	A	6	6	20810	20815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_015922	GAT	2	6	20818	20823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015922	GCA	2	6	20825	20830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_015922	TTGCTA	2	12	20864	20875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
307	NC_015922	A	7	7	20901	20907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_015922	AGAA	2	8	20949	20956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
309	NC_015922	A	6	6	20955	20960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_015922	A	6	6	20975	20980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_015922	ATT	2	6	21028	21033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_015922	T	6	6	21032	21037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_015922	T	7	7	21080	21086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_015922	AAT	2	6	21100	21105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_015922	AGA	2	6	21202	21207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
316	NC_015922	TTA	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_015922	ATA	2	6	21540	21545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_015922	TAA	2	6	21567	21572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_015922	A	6	6	21571	21576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015922	TAA	2	6	21591	21596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015922	ATA	2	6	21646	21651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015922	T	6	6	21673	21678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015922	A	6	6	21871	21876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015922	TATAA	2	10	22662	22671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015922	AAT	3	9	22675	22683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_015922	AAT	2	6	22691	22696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_015922	TAA	3	9	22711	22719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_015922	TAT	2	6	22729	22734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_015922	T	6	6	22758	22763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_015922	TTG	2	6	22783	22788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
331	NC_015922	GAG	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.